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Compostella, Roberto (2012) Ottimizzazione di algoritmi per la regressione logistica nell'ambito di Genome-Wide Association Studies. [Magistrali biennali]

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Abstract

In questa relazione è stato analizzato il pacchetto GLMNET che viene utilizzato per il calcolo delle funzioni di regressione logistica. Funzione utilizzata nei Genome-Wide Association Studies per l'identificazione del migliore insieme di SNPs che descrivono una malattia. Dopo aver analizzato l'algoritmo è stata adattata la parte di codice presente nel pacchetto GLMNET per risolvere questo problema. Prima di effettuare le ottimizzazioni vere e proprie è stato individuato il valore di alpha migliore per ciascun tipo di diabete confrontando le accuratezze date da ogni modello ottenuto variando alpha sul test set. Il programma è stato infine ottimizzato attraverso la parallelizzazione della k-fold cross-validation per trovare il lambda ottimo riducendone anche il numero di iterazioni, del collo di bottiglia individuato e del blocco di codice che calcola la normalizzazione della matrice X

Item Type:Magistrali biennali
Corsi di Diploma di Laurea:Scuola di Ingegneria > Ingegneria Informatica
Scuola di Ingegneria > Ingegneria Informatica
Additional Information:Embargo per motivi di segretezza e di proprietà dei risultati e informazioni sensibili
Subjects:Area 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione > ING-INF/05 Sistemi di elaborazione delle informazioni
Codice ID:41579
Relatore:Pietracaprina, Andrea
Correlatore:Di Camillo, Barbara and Sambo, Francesco and Silvestri, Francesco
Data della tesi:23 October 2012
Biblioteca:Polo di Ingegneria > Biblioteca di Ingegneria dell'Informazione e Ingegneria Elettrica "Giovanni Someda"
Tipo di fruizione per il documento:on-line per i full-text

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