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Antonello, Morris (2014) New Robust Similarity Measures Derived from Entropic Profiles. [Magistrali biennali]

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Abstract

Enhancers are stretches of DNA that play a major role in development geneexpression. They contain short DNA motifs so that their classification can be addressed by alignment-free compositional approaches. The contributions of this work are the development of the statistical properties of entropic profiles and the definition of new similarity measures derived from them. Experiments on both simulated and real enhancers reveal that the multi-resolution property enhances the similarity scores

Item Type:Magistrali biennali
Corsi di Diploma di Laurea:Scuola di Ingegneria > Ingegneria Informatica
Scuola di Ingegneria > Ingegneria Informatica
Uncontrolled Keywords:enhancers, tbfs, alignment-free, multi-resolution, entropic profiles, expectation, variance, covariance
Subjects:Area 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione > ING-INF/05 Sistemi di elaborazione delle informazioni
Codice ID:46131
Relatore:Comin, Matteo
Data della tesi:14 July 2014
Biblioteca:Polo di Ingegneria > Biblioteca di Ingegneria dell'Informazione e Ingegneria Elettrica "Giovanni Someda"
Tipo di fruizione per il documento:on-line per i full-text
Tesi sperimentale (Si) o compilativa (No)?:Yes

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