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Altomare, Denis (2015) Compression and fast retrieval of genomic wide genetic variants. [Magistrali biennali]

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Abstract

This thesis presents several improvements to SNPack 1.0, a state of the art algorithm for compressing and retrieving genetic data, designed for large scale association studies. The algorithm has been improved in terms of compression time, compression ratio, loading time and type of data that can be handled. A comparison with SNPack 1.0 and with the other state of the art tools highlights the superior performance of the new SNPack version

Tipologia del documento:Magistrali biennali
Informazioni aggiuntive:Embargo per motivi editoriali
Parole chiave:compression, snp, genetic, variants, dna, snpack
Settori scientifico-disciplinari del MIUR:Area 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione > ING-INF/06 Bioingegneria elettronica e informatica
Codice ID:47982
Relatore:Di Camillo, Barbara
Data della tesi:10 Marzo 2015
Biblioteca:Polo di Ingegneria > Biblioteca Interdipartimentale di Ingegneria dell'Informazione e Ingegneria Elettrica
Tipo di fruizione per il documento:on-line per i full-text
Tesi sperimentale (Si) o compilativa (No)?:

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