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Piotto, Celeste (2015) Validazione funzionale di interazioni miRNA-mRNA per radiosensibilizzare cellule tumorali umane A549. [Magistrali biennali]

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Abstract

La resistenza alle radiazioni ionizzanti (IR) è il fattore principale che limita l’efficacia terapeutica della radioterapia dei tumori. La radio-resistenza è spesso correlata con la sovra-espressione di geni coinvolti nei meccanismi di riparazione del DNA, in particolare le doppie rotture (double-strand breaks, DSBs). Lo scopo di questo studio, condotto in cellule umane radio-resistenti (A549), è di investigare se l’espressione di geni coinvolti nella riparazione di DSBs possa essere regolata tramite microRNAs (miRNAs), sensibilizzando le cellule alle radiazioni. I miRNAs tipicamente diminuiscono l’espressione genica mediante associazione diretta con i trascritti target. A questo scopo ho costruito dei vettori plasmidici contenenti la porzione 3’-UTR dei geni RAD51 e LIG1, coinvolti il primo nella ricombinazione omologa e il secondo nella ricombinazione omologa e non-omologa, ed ho eseguito la validazione funzionale con i miRNAs miR-96, miR-144, miR-874, e miR-342, scelti sulla base di predizioni bioinformatiche. In seguito, ho analizzato gli effetti dei miRNAs validati sulla sopravvivenza di cellule A549, e per confronto nelle stesse cellule trattate con inibitori proteici di due proteine chiave coinvolte nei meccanismi di riparazione omologa e non-omologa (RAD51 e DNA-PKcs).

Tipologia del documento:Magistrali biennali
Parole chiave:miRNA, Rotture a doppio filamento, HR, NHEJ
Settori scientifico-disciplinari del MIUR:Area 05 - Scienze biologiche > BIO/11 Biologia molecolare
Codice ID:52616
Relatore:Mognato, Maddalena
Data della tesi:2015
Biblioteca:Polo di Scienze > CIS "A. Vallisneri" - Biblioteca Biologico Medica
Tipo di fruizione per il documento:on-line per i full-text
Tesi sperimentale (Si) o compilativa (No)?:

Bibliografia

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1. The DNA-damage response in human biology and disease, Stephen P. Jackson and Jiri Bartek. Nature, 2009, doi:10.1038/nature08467 Cerca con Google

2. The MRN complex in Double-Strand Break Repair and Telomere Maintenance, 2012, B randon J Lamarche, Nicole Orazio, and Matthew D Weitzman, FEBS Lett. 584(17): 3682–3695 Cerca con Google

3. Posttranscriptional regulation of gene expression—adding another layer of complexity to the DNA damage response, 2012, Jorge Boucas, Arina Riabinska, Mladen Jokic, Grit S. Herter-Sprie, Shuhua Chen, Katja Höpker and H. Christian Reinhard, Front Genet. doi: 10.3389/fgene.2012.00159 Cerca con Google

4. DNA double-stranded breaks induce histone H2AX phosphorylation on serine 139, 1998, Rogakou EP1, Pilch DR, Orr AH, Ivanova VS, Bonner WM, J Biol Chem, 273(10):5858-68 Cerca con Google

5. Controlling DNA-end resection: a new task for CDKs, 2013, L. P. Ferretti , Lafranchi L, Sartori AA, Front Genet. 3;4:99 Cerca con Google

6. Initiation of DNA double strand break repair: signaling and single-stranded resection dictate the choice be-tween homologous recombination, non-homologous end-joining and alternative end-joining, 2012, Anastazja Grabarz, Aurélia Barascu, Josée Guirouilh-Barbat, Bernard S Lopez Am J, Cancer Res 2(3):249-268 Cerca con Google

7. Expression of the human RAD51 gene during the cell cycle in primary human peripheral blood lymphocytes, 1996, Jenny Flygare, Fiona Benson, Dennis Hellgren, Elsevier, doi:10.1016/0167-4889(96)00040-7 Cerca con Google

8. Small molecules, inhibitors of DNA-PK, targeting DNA repair, and beyond, 2013, David Davidson, Lilian Amrein, Lawrence Panasci and Raquel Aloyz, Frontiers in Pharmacology, Pharmacology of Anti-Cancer Drugs Volume 4, Article 5 Cerca con Google

9. Structural insights into NHEJ: building up an integrated picture of the dynamic DSB repair super complex, one component and interaction at a time, 2014, Williams GJ, Hammel M, Radhakrishnan SK, Ramsden D, Lees-Miller SP, Tainer JA, DNA Repair (Amst). 17:110-20 Cerca con Google

10. Defects in XRCC4 and KU80 differentially affect the joining of distal non-homologous ends, 2007, Guirouilh-Barbat J, Rass E, Plo I, Bertrand P, Lopez BS, Proceedings of the National Academy of Sciences, DOI: 10.1073/pnas.0708541104 Cerca con Google

11. Homology and enzymatic requirements of microhomology-dependent alternative end joining, 2015, Sharma S, Javadekar SM, Pandey M, Srivastava M, Kumari R, Raghavan SC, Cell Death Dis.doi: 10.1038/cddis.2015.58 Cerca con Google

12. DNA-dependent Protein Kinase Regulates DNA End Resection in Concert with Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN) and Ataxia Telangiectasia-mutated (ATM), 2013, Yi Zhou and Tanya T. Paull, J Biol Chem. 288(52):37112-25. doi: 10.1074/jbc.M113.514398 Cerca con Google

13. The absence of Ku but not defects in classical non-homologous end-joining is required to trigger PARP1-dependent end-joining, 2013, Mansour WY1, Borgmann K, Petersen C, Dikomey E, Dahm-Daphi J, DNA Repair 1134–1142 Cerca con Google

14. Comparison of nonhomologous end joining and homologous recombination in human cells, 2008, Zhiyong Mao, Michael Bozzella, Andrei Seluanov, Vera Gorbunova, DNA Repair (Amst), 7(10): 1765–1771. Cerca con Google

15. Small silencing RNAs: an expanding universe, 2009, Megha Ghildiyal and Phillip D. Zamore, Nature Reviews Genetics 10, 94-108, doi:10.1038/nrg2504 Cerca con Google

16. The Role of miRNAs in Regulating Gene Expression Networks, 2013, Allan M. Gurtan and Phillip A. Sharp, J Mol. Biol. 425, 3582–3600 Cerca con Google

17. miRNA gene counts in chromosomes vary widely in a species and biogenesis of miRNA largely depends on transcription or post-transcriptional processing of coding genes, 2014, Atanu Ghorai and Utpal Ghosh, Front Genet, doi: 10.3389/fgene.2014.00100 Cerca con Google

18. microRNA Expression and Biogenesis in Cellular Response to Ionizing Radiation, 2014 Aihong Mao, Yang Liu, Hong Zhang, Cuixia Di and Chao Sun García-Castillo, Jacobo-Herrera, Herrera LA, Peralta-Zaragoza López-Camarillo, De Leon, Fernández-Retana, Cerna-Cortés, Pérez-Plasenci, DNA Cell Biol. 33(10): 667–679. Cerca con Google

19. MicroRNAs: new players in the DNA damage response, 2011, Hailiang Hu and Richard A. Gatti, J Mol Cell Biol. 3(3):151-8. doi: 10.1093/jmcb/mjq042 Cerca con Google

20. Analysis of miRNA and mRNA Expression Profiles Highlights Alterations in Ionizing Radiation Response of Human Lymphocytes under Modeled Microgravity, 2012, Cristina Girardi, Cristiano De Pittà , Silvia Casara, Gabriele Sales, Gerolamo Lanfranchi, Lucia Celotti, Maddalena Mognato, Plos One, DOI:10.1371/journal.pone.0031293 Cerca con Google

21. Protective role of miR-155 in breast cancer through RAD51 targeting impairs homologous recombination after irradiation, 2014, Pierluigi Gasparini,a Francesca Lovat,a Matteo Fassan,a,b Lucia Casadei,a Luciano Cascione,a,c Naduparambil Jacob, Stefania Carasi, Dario Palmieri, Stefan Costinean e Charles Shapiro,f Kay Huebner,a and Carlo M. Crocea, Proc Natl Acad Sci U S A. 111(12): 4536–4541 Cerca con Google

22. Targeting DNA-PKcs and ATM with miR-101 Sensitizes Tumors to Radiation, 2010, Dan Yan, Wooi Loon, Xiangming Zhang, Ping Wang, Zhaobin Zhang, Yin-Yuan Mo, Hui Mao, Chunhai Hao, Jeffrey J. Olson, Walter J. Curran, Ya Wang, Plos One, DOI: 10.1371/journal.pone.0011397 Cerca con Google

23. Basic mechanisms of therapeutic resistance to radiation and chemotherapy in lung cancer, 2013, Willers H1, Azzoli CG, Santivasi WL, Xia F, Cancer J. 19(3):200-7. doi: 10.1097/PPO.0b013e318292e4e3 Cerca con Google

24. A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR, 2001, Michael W.Pfaffl, Nucleic Acids Research Vol. 29, No. 9 00 Cerca con Google

25. Investigation of Radiation-induced Transcriptome Profile of Radioresistant Non-small Cell Lung Cancer A549 Cells Using RNA-seq, 2013, Hee Jung Yang, Namshin Kim, Ki Moon Seong, HyeSook Youn, BuHyun Youn, Plos One, DOI: 1371/journal.pone.0059319 Cerca con Google

26. Frameshift mutation in PRKDC, the gene for DNA-PKcs, in the DNA repair-defective, human, glioma-derived cell line M059J, 2001, Anderson CW1, Dunn JJ, Freimuth PI, Galloway AM, Allalunis-Turner MJ, Radiat Res. 156(1):2-9. Cerca con Google

27. Signal integration by JNK and p38 MAPK pathways in cancer development, 2009, Wagner EF, Nebreda AR, Nat Rev Cancer, 9(8):537-49. doi: 10.1038/nrc2694. Cerca con Google

28. NER Initiation Factors, DDB2 and XPC, Regulate UV Radiation Response by Recruiting ATR and ATM Kinases to DNA Damage Sites, 2013, Alo Ray1, Keisha Milum, Aruna Battu, Gulzar Wani, and Altaf A. Wani, DNA Repair (Amst), doi:10.1016/j.dnarep.2013.01.003 Cerca con Google

29. Radiation oncology: a century of achievements, 2004, Jacques Bernier, Eric J. Hall & Amato Giaccia, Nature Rev Cancer 4, 737-747 doi:10.1038/nrc1451 Cerca con Google

30. Human Cytomegalovirus Infection Alters the Expression of Cellular MicroRNA Species That Affect Its Replication, 2008, Fu-Zhang Wang, Frank Weber, Carlo Croce, Chang-Gong Liu, Xudong Liao,and Philip E. Pellett, JOURNAL OF VIROLOGY, No. 18 doi:10.1128/JVI.00961-08 Cerca con Google

31. MicroRNAs Used in Combination with Anti-Cancer Treatments Can Enhance Therapy Efficacy, 2015, Maddalena Mognato and Lucia Celotti Mini-Reviews in Medicinal Chemistry, 1052-1062 Cerca con Google

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