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Marchiori, Davide (2016) Implementazione e analisi di metodi per la scoperta di k-mers discriminativi nella classificazione di sequenze metagenomiche. [Magistrali biennali]

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Abstract

La tesi propone l'implementazione e analisi di metodi per la determinazione di k-mers discriminativi nella classificazione di sequenze metagenomiche. In particolare studia il funzionamento dell'algoritmo utilizzato dal classificatore Kraken e ne propone delle varianti basate sulla ‘discriminatività’ di un k-mer. Analizza i risultati statistici ottenuti con le nuove implementazioni e ne valuta l'impatto sulla qualità delle classificazioni e sulle risorse necessarie

Item Type:Magistrali biennali
Corsi di Diploma di Laurea:Scuola di Ingegneria > Ingegneria Informatica
Scuola di Ingegneria > Ingegneria Informatica
Uncontrolled Keywords:metagenomica, bioinformatica, classificazione
Subjects:Area 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione > ING-INF/05 Sistemi di elaborazione delle informazioni
Codice ID:53211
Relatore:Comin, Matteo
Data della tesi:10 October 2016
Biblioteca:Polo di Ingegneria > Biblioteca di Ingegneria dell'Informazione e Ingegneria Elettrica "Giovanni Someda"
Tipo di fruizione per il documento:on-line per i full-text
Tesi sperimentale (Si) o compilativa (No)?:Yes

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