I sistemi ecologici sono sistemi complessi: i diversi elementi che li costistuiscono interagiscono tra loro su scale (di lunghezza e temporali) diverse, dando origine a fenomeni collettivi non trivialmente spiegabili come sovrapposizione lineare della dinamica delle singole specie. Questi sistemi mostrano sorprendenti comportamenti universali (ossia indipendenti dai dettagli del sistema osservato). Questi pattern possono essere spiegatiutilizzando un approccio basato su processi stocastici ed idee della meccanica statistica, che vanno sotto il nome di teoria neutrale. Analoghe proprietà emergenti sono anche osservabili nell’organizzazione dei genomi. Negli ultimi anni sta crescendo la disponibilità di dati di metagenomica, in cui interi ecosistemi vengono sequenziati. Nasce quindi la possibilità di legare i pattern della microscala (genomica) con quelli alla macroscala (ecologia). In questa tesi si affronterà lo studio della dinamica di popolazione di geni, in particolare si analizzeranno i modelli di Wright-Fisher e di Moran e la loro relazione con l’ecologia.

Modelli stocastici di genetica delle popolazioni

Polato, Carlo
2018/2019

Abstract

I sistemi ecologici sono sistemi complessi: i diversi elementi che li costistuiscono interagiscono tra loro su scale (di lunghezza e temporali) diverse, dando origine a fenomeni collettivi non trivialmente spiegabili come sovrapposizione lineare della dinamica delle singole specie. Questi sistemi mostrano sorprendenti comportamenti universali (ossia indipendenti dai dettagli del sistema osservato). Questi pattern possono essere spiegatiutilizzando un approccio basato su processi stocastici ed idee della meccanica statistica, che vanno sotto il nome di teoria neutrale. Analoghe proprietà emergenti sono anche osservabili nell’organizzazione dei genomi. Negli ultimi anni sta crescendo la disponibilità di dati di metagenomica, in cui interi ecosistemi vengono sequenziati. Nasce quindi la possibilità di legare i pattern della microscala (genomica) con quelli alla macroscala (ecologia). In questa tesi si affronterà lo studio della dinamica di popolazione di geni, in particolare si analizzeranno i modelli di Wright-Fisher e di Moran e la loro relazione con l’ecologia.
2018-09-10
44
Fisher, Wright, Moran, voter, modelli stocastici, catene di markov, genomica, ecologia, teoria neutrale, dinamica delle popolazioni
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/24230